南京大学和吉林大学相比，当然是南京大学更好，不是好一些，而是好很多。南京大学和吉林大学，从官方的某些角度来看，是同一个层次的学校。比如：两所学校都是教育部直属和中央直管的副部级大学，都是211工程大学、985工程大学、双一流建设A类大学，都是有权自主设置博士点的高校，都是研究生招生自主划线高校。广大群众的看法但是在民间的看法，南京大学与吉林大学的层次，中间隔了好几个台阶。
在网络江湖中的高校圈了，南京大学的地位，比吉林大学高出很多。如果是按照高考录取分数来划分学校层次，我们来看看南京大学与吉林大学中间隔了几个层次：我国高校中录取分数最高的层次，清华大学与北京大学。其他学校谁也没法和他们两平起平坐。我国高校中录取分数第二高的层次，是华东五校及中国人民大学。华东五校就是上海交通大学、复旦大学、中国科学技术大学、浙江大学、南京大学。
其他学校也很难与他们平起平坐。第三个层次，一般称为航开济，就是北京航空航天大学、南开大学、同济大学。和他们的平起平坐的还有“两财一贸”：中央财经大学、上海财经大学、对外经济贸易大学。第四个层次，是“中坚九校”和“两外一法”、“两电一邮”。中坚九校有：北京理工大学、天津大学、哈尔滨工业大学、东南大学、厦门大学、武汉大学、华中科技大学、中山大学、西安交通大学。
“两外一法”就是北京外国语大学、上海外国语大学、中国政法大学。“两电一邮”就是电子科技大学、西安电子科技大学、北京邮电大学。这个层次还应该包括北京师范大学、西南财经大学、中南财经政法大学。另外西安电子科技大学的录取分数到不了这个层次。第五个层次，其他985工程大学，部分发强势211工程大学。这个层次跨度比较大，具体学校名单不列举了。
到这里才出现吉林大学。从民间给大学的层次划分可以看出，南京大学比吉林大学高出三个层次。专业水平相差悬殊两所学校的专业水平，从教育部第四轮学科评估结果可以有明显的区分。南京大学在教育部第四轮学科评估中，共有41个学校上榜，其中有21个A类学科：最高评级为3个A 学科，次高评级为11个A级学科，评级为A-的学科有7个。
吉林大学在教育部第四轮学科评估中，共有56个学科上榜，其中有11个A类学科：最高评级为2个A级学科，次高评级为9个A-学科。从学科学科评估结果对比来看，吉林大学规模比较大学，但是学科精度不够。南京大学虽然上榜学科数量不如吉林大学，但是高水平学科数量明显多过吉林大学，而且是差距比较悬殊。这也正是两所学校在专业水平方面的对比。
