个体户生产经营个人所得税计算公式如下：应纳税所得额＝收入总额-成本、费用及损失-起征点；应纳税额=应纳税所得额*适用税率。其适用的税率以及税率类型为5%至35%的5级超额累进税率；个体工商户的生产、经营所得应纳的税款，按年计算，分月预缴，年度终了后3个月内汇算清缴，多退少补。
1.核定征收的情况如下
以开票不含税收入，直接乘以税务核定的成本利润率（一般是10%，具体看税务局的情况），乘以成本利润率后的就是应纳税所得额，然后再依照个体的经营所得税率表找出所对应的税率及速算扣除数计算应缴纳的个人所得税。
举例：假如不含税收入为10万，成本利润率假定10%，应缴纳个税10万*10%*5%=500元。
2.查账征收的情况如下
查账征收先以不含税收入，减去当期成本费用，扣除前期损失，以及经营者每月5000的减免额（如果经营者在其他处取得工资所得，那每月的5000减免额只能随工资取得处扣除），剩余的利润就是应纳税所得额，然后按照经营所得税率表找出对应税率和速算扣除数计算应缴纳的个人所得税。
举例：假定当期不含税收入10万，当期成本费用合计5万，前期损失3万，假定经营者在其他公司有取得的工资薪金所得，那个税为（10万—5万—3万）=2万*5%=1000元。
注意：查账征收个体户，第二年一月至三月底需要对个人所得税做年终汇算清缴。
