松花江有南北两源，南源为正源。南源西流松花江源于长白山天池，全长958千米，流域面积78180平方千米，占松花江流域总面积的14.33%，它供给松花江干流39%的水量。北源嫩江也是松花江第一大支流，发源于大兴安岭伊勒呼里山，全长1379千米，流域面积28.3万平方千米，占松花江总流域面积的51.9﹪，它供给松花江干流的31﹪的水量。
两江在吉林省三岔河镇汇合后形成东流松花江，流至同江市注入黑龙江。东流松花江长939千米，流域面积18.64万平方千米。 说起洪水，有水的地方自然就有洪水隐患。而松花江如此大的水系自是洪水的高发区域。一般来说，洪水多发生于下游区域，黑龙江省就是松花江流域洪水猛兽的高发区域。据资料记载，松花江共发生过三次比较大洪水。
解放前的1932年发生第一次大洪水，洪峰最高值为119.72米，造成2万多人丧生，12万人无家可归。第二次发洪水发生在解放后的1957年，发生在松花江干流，最好水位达120.30米，洪水持续21天，在共产党的英明领导下，共出动100万人参加抗洪抢险，经过一个月的抗洪斗争，最终取得了抗洪抢险的胜利。为了纪念抢险的丰硕成果，1958年，哈尔滨市修建了防洪纪念碑。
