有一个不得不考虑的问题，南云的2波攻击飞机都没有发现美军的3艘航母，作为一名航母指挥官他不可能弃之不顾，这三艘本该在港内的航母去哪里了？会在哪里出现？会不会偷袭日军的机动舰队？这是南云忠一时刻考虑的问题，因此他不敢在夏威夷附近久留，和飞行员相比，赤城、加贺、苍龙、飞龙、翔鹤、瑞鹤这6艘航母更加珍贵。
偷袭珍珠港，南云为什么不轰炸油库？
没有用的，诺大一个美国不缺那点油，在南云忠一看来，冒险派出第三波攻击部队是不值得的，他的机动舰队6艘航母765名飞行员，是日本几十年积攒下来的精华，必须尽可能地保留下来，毕竟太平洋战争才刚刚开始。南云的2波攻击损失了29架飞机，这其中包括9架零战、5架97舰攻、15架99舰爆，也就是说已经有55人殒命了！他们的座机一旦被击中不是玉碎就是被俘！著名的飞龙号航母舰载机飞行员西开地重德和石井三郎二，就是损失的9名零战飞行员之二，石井三郎二不愿意自己的飞机被美国缴获选择飞向大海，燃料耗尽后坠海身亡，而西开地重德则迫降到尼豪岛上梦想被日军潜艇接回去，最后也是身死他乡且害苦了10万日裔。
当时，珍珠港内有美军飞机390架，两波攻击后已经损失了188架，这说明美国空军还有能力保护珍珠港领空，甚至尾随日军舰载机攻击航母。比如西开地重德跟随飞龙号战斗机中队长重松康弘，共8架零战攻击珍珠港，在返航时就遇到美军9架P-36A的拦截，最终要了石井三郎二和西开地重德的命！作为战斗机指挥官，重松康弘肯定会向南云忠一回报，南云也有理由相信有更多的美军战斗机等待着日本飞机回到珍珠港，这肯定是他鸣金收兵的主要原因。
南云爱惜珍贵的航空兵，还体现在中途岛海战中。当时，南云忠一共有4艘航母和248架舰载机，其中有零战93架、九九舰爆72架、九七舰攻81架、二式舰侦2架；负责掩护的水面舰艇还有16架水上飞机，因此总共有264架飞机，粗略估算至少有600名飞行员，如果再加上备用的飞行员，四艘航母共搭载了700名飞行员左右，但航母沉没后只有110名飞行员阵亡，可见南云不仅自己不想死，她也不允许飞行员玉碎作战，也可以解释他为什么不愿意让飞行员冒险第三次攻击珍珠港了。
此外，南云派出第三波攻击摧毁油库真的有用吗？据说珍珠港内有450万吨油库，还有海军用的紧急造船、修船厂，尼米兹也认为日军没有攻击这两个目标是个失误。但尼米兹终究只是个潜艇司令、潜艇发动机专家，他的见识也没有我们想的那样高，因为美国家大业大根本不差这点东西，本土有的是，日军冒险攻击船坞和油库不会阻碍美军的反攻行动。
（航拍油库和船坞）珍珠港偷袭过后，美军受损的8艘战列舰仅有亚利桑那号、俄克拉荷马号全毁，剩余的6艘都被修复，而且只是在珍珠港的船坞里紧急处理后，拖到美国西海岸的造船厂修复的，更有意思的是这6艘战列舰并未参与日后的对日作战！因此，说南云即使摧毁了油库和船坞也没用，美军大不了不要这些派不上用场的船了。还有一个不得不考虑的问题，南云的2波攻击飞机都没有发现美军的3艘航母，作为一名航母指挥官他不可能弃之不顾，这三艘本该在港内的航母去哪里了？会在哪里出现？会不会偷袭日军的机动舰队？这是南云忠一时刻考虑的问题，因此他不敢在夏威夷附近久留，和飞行员相比，赤城、加贺、苍龙、飞龙、翔鹤、瑞鹤这6艘航母更加珍贵。
