孝靖皇后棺内出土的“罗地洒线绣百子衣”，亦采用升龙、行龙左右盘绕的图绘手法，龙旁以云水装饰，端庄且威严。与皇帝衮服不同，皇后衣着体现母仪天下之意，前后襟与两袖绣图为100个童子，姿态各异。周围以各类花卉与金银装饰，取“子孙万代，多福多寿”的之意。文物保护的失败虽然定陵出土了大量文物珍宝，但因为保护措施的落后，开挖人员经验欠缺，大量文物氧化严重，仅仅向世人展示了几个小时的风采便失去原来的面貌，造成不可逆转的损失。
且由于出土文物数量大，出土之后的保护和抢救力度不够，大多文物被凌乱的摆放在露天的院子里和研究所的简陋库房里，一放就是两三年。上面说到的皇冠、凤冠、衮服等珍贵国宝在出土后，由于氧化，逐渐失去光泽，已不复出土时的风采；由于袍服的材质娇贵，当时考古人员处理袍服时却用软化剂涂抹在衣物上，故而这些袍服几个月后又黑又硬，加之文物研究所的库房简陋，四面漏风，这些袍服出土后不久便成为了碎片，现在我们在定陵博物馆所能看见的完整衮服龙袍其实是复刻的。
万历皇帝的棺材由金丝兰木打造，本来就是文物，而在开挖时，当时的理念并未将此当做文物对待，被暴力拆开后当做垃圾扔至山沟中，当文物工作者反应过来时，回山里寻找却已不见踪迹，很可能被村民捡回家做了柴火或者家具。现在陈列于定陵地宫的棺材也是后期由水泥重建的。1966年这个特殊历史时期，定陵被称为“牛鬼蛇神”遭到批斗，万历皇帝和两位皇后的尸骨皆被焚毁，这使得吴晗本欲研究万历皇帝生前是否吸食大麻的项目破产。
历史意义定陵的开挖带来的文物损坏是考古界和历史界的一大悲剧，但对于历史研究也产生了一定的意义。万历皇帝是出了名的二十余年不上朝而饱受诟病，在史料中万历皇帝主要是由立储问题引起，但经过定陵的挖掘，专家发现了万历皇帝患有严重腿疾，这也为万历皇帝不上朝的原因找到了另一个方向的突破口。与此同时，万历皇帝的陵墓中只有两樽皇后同葬，左右两侧的配殿空空如也，并未葬入万历皇帝的爱妃郑贵妃，这与《明史》中百官阻止郑贵妃葬入定陵的记载是一致的。
因而也印证了明朝的政治体系中，皇帝是比较憋屈的，正如《万历十五年》里说到的，连立储都受大臣们的拼死抵制，万历皇帝也是生的伟大，死的憋屈。其次，虽然文物氧化严重，但其中展现出了我国古代高超的工艺水平，甚至是失传至今都无法复制。万历皇帝棺椁中出土的金冠是用518根直径0.2毫米的细金丝手工编织，质地均匀，疏密一致，二龙戏珠样式中的龙首、龙身、龙爪均是独立制作，但丝毫看不出焊接痕迹。
