和两栖动物的变态一样，比目鱼的变态最终是由甲状腺激素控制的。它于2008年7月发表在《自然研究》杂志上。芝加哥大学的进化生物学家在比目鱼的进化中发现了几种过渡形式，这种进化始于约5000万年前的始新世。比目鱼是所有脊椎动物中外形和侧向行为最不对称的动物之一。就连达尔文也对比目鱼不对称的解剖结构感到困惑。他写道，“幼比目鱼的眼睛是对称的，但很快眼睛就开始慢慢地绕着头部向上方滑动。比目鱼由此获得的主要优势似乎是免受敌人攻击和海底觅食的便利。
大多数动物都是对称的，为啥比目鱼类嘴歪眼斜，在进化的路上跑偏了？端正一点不好吗？
比目鱼是所有脊椎动物中形状最不对称、行为最侧向化的一种动物，即使是达尔文，对比目鱼解剖结构非对称结构感到困惑，他写道“年幼比目鱼，两眼对称，但很快眼睛开始慢慢地绕着头部向上侧滑动，比目鱼由此获得的主要优势似乎是免受敌人的攻击，以及在海床上觅食的便利。”虽然这种不对称的生存优势明显，但达尔文也无法解释这种相当突然和彻底的形态学变化的机制，甚至提出了一种拉马克式的适应过程，认为比目鱼通过肌肉动作，慢慢地把一侧眼睛往上拉，由此产生的扭曲“无疑会通过遗传而加剧”，
达尔文的解释依赖于后天性状的遗传，早于基因的发现。比目鱼在刚孵化时，像其他普通鱼类一样，在头的两侧各一只眼睛，虽然所有的脊椎动物在胚胎发生过程中都经历左右器官的不对称分布，但比目鱼的不同寻常之处在于，它们在变态过程中经历了额外的不对称重塑，一只眼睛从头顶逐渐移到另一边，在这个过程中头骨发生扭曲，因此比其他脊椎动物更偏离两侧对称的身体构造。
变态发育后比目鱼就从直立游动的浮游幼虫变成了沉到水底时侧卧的幼鱼，两只朝上的眼睛为它们提供了更大的视野，鱼的上半部分保持正常的颜色，下半部分变成白色，与两栖动物变态一样，比目鱼的变态发育过程最终都受甲状腺激素的控制在2008年7月发表在nature的研究中，芝加哥大学进化生物学家在发现了比目鱼进化过程中的几个过渡形式，这种进化始于始新世，大约5000万年前。
这两种原始的比目鱼分别是文昌鱼和异颈鱼。两种鱼都有许多现代比目鱼所没有的特征。最引人注目的是一只眼睛的部分移位，这一点甚至在两个多世纪前发现的第一个文昌鱼化石中就已经很明显了。两种原始比目鱼都存在眼眶移行，但都是不完全的，没有越过鱼两侧的中线。
