三藩之乱后，康熙推行的政策确实恢复了云南，保证了当地的长治久安。当时云南交通不便，从外地运粮极为不便。吴三桂任免云贵地区的大部分官员。云南作为吴三桂的大本营，受三藩之乱影响很大。康熙过去在云南的大部分弊政都被废除了。吴三桂死了，留下一个烂摊子给他的孙子吴世璠接管。
1678年吴三桂去世后，云南发生了什么？
1678年，吴三桂去世，留下一个烂摊子交给孙子吴世璠接手。三年后，清军攻入云南，吴世璠自尽，三藩之乱遂平。御史大夫何嘉佑立刻提出，要给康熙皇帝加尊号，认为现在能够平定天下，完全依赖康熙一人的功劳。何嘉佑冲在第一个后，官员们害怕自己落后，立刻蜂拥而上，拼命颂圣。康熙对于大臣的奉承却不认同。他对孝庄皇太后表示，叛乱平定后，将士疲敝，民众生活困苦，这时候应当整顿国家纲纪，进行战后恢复。
怎么能认为是太平时期，安心接受加尊号的事情。这种时候，康熙依然保持如此冷静客观的判断力，确实难得。当时全国在战乱后，都经历不同程度的损伤。云南也是如此。作为吴三桂的大本营，云南受三藩之乱影响较大。战争未爆发时，吴三桂就开始搜刮百姓，拼命敛财。战争爆发后，云南初期作为后勤基地，要接受盘剥。后期直接面临战争摧毁。
无论清军或者吴三桂军队，都对云南百姓造成不同程度的伤害。对康熙来说，既要推行适当政策，保证云南短期问题。更需要一套体制，保证云贵地区不再出现同样的叛乱，从而达到长治久安。短期内，最好的办法就是招抚流民，开垦荒地。过去以农业为主的时代，粮食生产压倒一切。康熙时，朝廷在这个基础上，又做了其他辅助措施。比如免除劳役租税，减轻赋税，为百姓发放耕牛种子，以及其他生产工具，鼓励他们开垦荒地，恢复生产。
官服对堵塞的河道及时进行疏通，为云南修建新的水利工程。这些惠民措施，都帮助云南缓和战争创伤，促进社会稳定。这些措施仅是对百姓而言，吴三桂留下的弊政和军队仍是潜在祸患。康熙对云南过去的弊政，大多选择废除。这能减轻百姓负担，也可以树立朝廷威信。至于那些零散军队。最初时，清朝曾打算将他们逮捕入京。不过，效果却不怎么样。
沿途兵员逃亡极多，只能改为招降。清朝给这些士兵发口粮，允许他们继续服役。也可以去开垦荒地，编入百姓保甲中。保甲是过去官府管理百姓所推行的制度。编入保甲后，可层层管制。就这个办法像他们管理军队屯田一样。屯田是为解决军队物资问题，让军户自行耕地，筹获物资。当时那些开垦军田的军户，就基本被固定在屯田上，接受管制。
当时云南交通不便，从外面运粮极为不便。以屯田办法，可以很好解决物资问题。可时间一长，军户不愿承担选择逃役，大片军田荒芜。清朝只能让把军田转为民田，交由百姓开垦。其实，三藩之乱后，云南最大的变化，就是土地制度的变化。过去明朝赐给官员亲王的庄田，也被清朝作价变卖，转为民田。正是有这些土地，康熙时期，云南才能进行如此大规模的开荒。
至于过去云南一直推行的土司制度，倒没有受到太大冲击。吴三桂时，曾主动打压少数民族的首领土司。三藩之乱后，清朝为拉拢土司，采用缓和政策。只是严加管制，并不急着废除。那些土匪盗贼，也受到打压。这都是为了保证清朝的统治。这些措施的背后，都是清朝军力作为保障。云南地处边境，与邻国接壤，如果当地军力空虚，很难保证不被入侵。
内部矛盾重重。三藩之乱后，清朝把军队统一划编，统一归朝廷指挥。又迅速调遣6900员兵丁，分驻云南各处战略要地，以军事实力震慑，保障后续政策推行。只有军队还是不够，更需要财政支持。庄田被变卖，也是为了增加朝廷经费收入。除了赋税收入，清朝又把矿盐收入揽在自己手中。吴三桂时，曾私自开采铜矿金矿，收益丰厚。
清朝也想把它们放进国库。但是这个过程会比前几次稍微慢一点。因为过程艰难。就铜矿而言，铜可以用来制造货币或武器。康熙二十一年，时任云贵总督的蔡玉荣提出了云南十疏的建议，其中就有开采铜矿的建议。这个建议被康熙采纳，但是在实施的过程中，出现了很多问题。当时，采矿业被官员私人占有。直到康熙四十四年，时任云贵总督的北和若对铜矿进行改革，才使云南的矿税迅速增加。
