第二次华山论剑，王重阳已逝，郭靖少年英杰刚过二十岁，接黄药师、洪七公三百招不败。黄药师、洪七公便默认郭靖天下第一。欧阳锋虽然武功卓绝，黄药师、洪七公都难以胜他。可他因为练了假的《九阴真经》，全身筋脉逆转。黄蓉伶牙俐齿，最后将欧阳锋给说疯了。至于「南帝」段智兴因为出家，法号「一灯」，早已看破名利，故没有参与这次论剑。
1234年，金国灭于蒙古与南宋联合进攻。1235年，穆念慈染病身亡，11岁的杨过流落嘉兴。明教高手参考五代十国时期武林高手慕容龙城的“斗转星移”，创出威力更大的“乾坤大挪移”神功，遂为镇教之宝。1238年，14岁的杨过获郭靖接到桃花岛居住，后被送至全真教，又被古墓派小龙女收养，同习玉女心经。1243年，洪七公、欧阳峰去世。
1243年，杨过小龙女双剑合壁初试锋芒挫败金轮法王；杨过学弹指神通。1243年，十月廿四，郭襄出生；同年，杨过断臂，初入独孤求败剑冢。1247年，张三丰出生。1253年，蒙古灭大理国。1257年，明教石教主圣火令为丐帮所夺。1259年初春二月，郭襄在风陵渡口听到“神雕侠”种种豪侠义举，不由得悠然神往，恨不得马上见“神雕侠”一面。
几经波折，她得以一睹真容。离别之际，“神雕侠”送她三枚金针，答应为她做三件事情。同年，杨过飞石击毙蒙哥大汗；第三次「华山论剑」，杨过获封“新五绝”之一的“西狂”，结识觉远禅师、张君宝等人，最终归隐。1262年，郭襄游少林。元1271年，忽必烈取《易经》“大哉乾元”之义，建国号为大元。1273年，一代大侠郭靖和黄蓉战死襄阳，屠龙刀亦于此役中失去踪迹。
1276年，蒙古攻进南宋都城临安。1283年，郭襄大彻大悟，出家为尼，创立峨眉派，既是继承父母遗志，也是自己的一次蜕变。1296年，金毛狮王谢逊出生。1302年，杨逍出生。1317年，谢逊离开师父成昆，加入明教。1318年，武当六弟子殷梨亭出生。1323年，成昆杀谢逊一家。1336年，谢逊及张翠山夫妇至冰火岛。
1337年，张三丰九十大寿；张无忌出生。1338年，元兵剿灭袁州明教义军，常遇春、彭莹玉侥幸逃脱。1339年，周芷若出生。1340年，汝阳王女儿敏敏特穆尔出生，元帝封其“绍敏郡主”。她是谁啊，她是皇上御封的绍敏郡主啊，她爹可是掌握枪杆子的天下兵马大元帅汝阳王啊！她呀，天生骄傲！1341年，小昭出生。1346年，张三丰百岁大寿；张翠山殷素素夫妇自尽。
1351年，张无忌得九阳神功。1357年，六大派围攻光明顶；张无忌任明教教主；张三丰首创太极神功。1358年，小昭远走波斯。1359年，少林屠狮英雄会；白眉鹰王殷天正去世。1360年，张无忌隐退，光明左使杨逍继任为明教第三十五代教主。1365年，明教光明右使范遥参考北宋年间的两大神功“北冥神功”及“化功大法”，创出威力极大更为歹毒的“吸星大法”。
