619年他率军进攻山西，山西全境几乎被攻陷。李世民带领李世民征讨宋金刚，宋金刚手下的大将尉迟恭非常厉害，但是和秦琼交手两次都败北了，第二次是一个人逃跑的。因为缺少粮食宋金刚撤退，被唐军掩杀大败而回，尉迟恭被李世民收服。2.征讨王世充、窦建德。出于作战的需要，李世民建立了1000人的精锐部队，被称为“玄甲军”，秦琼、程咬金、尉迟恭、翟长孙四人统帅。
每战“玄甲军”都是先锋，敌人对玄甲军闻风丧胆。王世充抵挡不住唐军的进攻，龟缩洛阳不出，求救于窦建德，窦建德率军十几万援助。李世民让李元吉继续围困洛阳，自己率领军队主力迎击窦建德。621年5月，李世民麻痹敌军，秦琼、程咬金等率领精锐先锋击穿窦建德主力大军的军阵，直接来到了窦建德军队后方，展开唐军旗帜，窦建德军队认为已经失败，纷纷溃退，窦建德兵败被俘。
此战，秦琼率先领军突击，击破窦建德军队的阵营，被记为首功。被围困在洛阳的王世充眼见援军被击败，窦建德被杀，只好乖乖的投降了。3..征讨刘黑闼。窦建德虽然被杀，但是他的部下怕唐军的报复，拥立刘黑闼为主反唐，很快占据河北之地。李世民率军平叛，622年，李世民和秦琼击败刘黑闼主力，收复河北。4.参与玄武门之变。
626年，秦琼跟随李世民发动玄武门之变。秦琼被封为左武卫大将军，食邑700户，不过这个职位很快被程咬金所取代，因为秦琼病了，不能胜任此项工作，他自己这样说：“吾少长戎马，所经二百余阵，屡中重疮。计吾前后出血亦数斛矣，安得不病乎？”征战的次数达到200多次，几乎每战都是先锋，身体已经不行了。秦琼、尉迟恭和门神。
秦琼在征讨宋金刚时，次次击败尉迟恭，打的尉迟恭心服口服。尉迟恭归顺后，两个人反而成了至交好友，在作战中一直是同事。（尉迟恭像）秦琼作战勇猛，身体不行，死的比较早。尉迟恭对他非常尊敬，把自己的孙女嫁给了秦琼的儿子秦怀道，结成了秦晋之好。关于二人成为门神的传说有两个：第一，小说中记载魏征斩杀了泾河龙王，龙王的鬼魂经常搞得李世民睡不好觉，经常做噩梦。
秦琼和尉迟恭自愿守卫李世民的寝宫，李世民睡得安稳了，也不能让两位大将整天值夜班啊，长孙皇后想了一个注意，把他们二人的画像贴到门上，解决了这一问题。第二个原因就是李世民杀死了自己的兄弟李建成和李元吉，经常做噩梦，后续传说和上面是一样的。民间对此纷纷效仿，将二人的画像，贴到大门上辟邪，成为了门神。秦琼被李世民列入凌烟阁24功臣，排名在最后，主要是因为秦琼伤病，后期没有作战功劳，因此排名靠后了。
李靖和薛仁贵功劳那么大，为什么没有秦琼名气大？你认为谁是唐朝名将？
李靖是大唐军神，古代著名军事家，灭萧梁、败辅公拓定江南，灭东突厥，败吐谷浑是秦以后最伟大的军事家。薛仁贵是唐初名将，三箭定天山，神勇收辽东，仁政高句丽，爱民象州城，脱冒退万敌是大唐传奇名将，而秦权宝曾六易其主，没什么大的战绩，充当保镖角色，居然能名动天下，柄柄史册，名气超过军神和名将实在是历史上達运儿之一。
.、历史上的秦琼是隋朝将领，在历史转折时期跟来护儿，张须陀，李密，王世聪等人混过。在两军阵前，和程咬金等人投降了秦王李世民，六易其主。《隋唐演义》中说秦琼跨下黄标马，掌中一对熟铜双锏，马跨黄河两岸，锏打山东六府，是员猛将。实际上，秦琼使用的武器是马槊，力量型战将。李世民每次领军打仗时，秦琼不离左右。遇到有挑战的敌将，李世民必派秦琼出马，秦琼力猛槊沉马急，常常是马到成功。
秦琼经常冲阵，经常受伤流血数升，大伤元气。长期养病贞观初年病逝，凌烟阁二十四功臣之一。秦琼没有领军作战，不是独当一面的名将，他只不过是个保镖角色。秦琼名气大主要有三个原因。一，秦琼是李世民死党之一，凌烟阁二十四功臣之一，龙虎榜上有一号，故知名度比后起之秀薛仁贵要高。二，秦琼名声大是受《隋唐演义》影响，这部小说流行面非常广，单田芳大师的评书声情并茂，人人爱听，所以，秦琼的名字知名度亦声名鹊起。
三，秦琼和尉迟恭是著名的门神。相传唐太宗李世民病重时，秦琼和尉迟恭全身披挂，手持兵器立于门两侧，李世民的病居然好了。民间百姓认为二位勇将能趋鬼神，遂家家户户在门上帖二人画像以求吉利，千百年流传，秦琼名将的身份己深入平常百姓心里，而李靖，薛仁贵等神级名将反而星光暗淡了，这里不得不配服文学力量和民俗的魅力和力量。
