顾城写道：黑夜给了我黑色的眼睛，我却用它来寻找光明。换成外国版估计就是天空给了我蓝色的眼睛，花草给了我绿色的眼睛，不过，眼睛颜色当然不是大自然赋予的，那么，眼睛的颜色是由什么决定的呢？眼睛的颜色由什么决定？当我们讨论眼睛的颜色时，指的其实是虹膜的颜色。虹膜可以大致分为虹膜基质层和虹膜色素上皮层，这两层结构中的黑色素含量以及虹膜基质层中的细胞密度共同决定了虹膜呈现出的颜色。
黑色素是一类黑褐色的色素，可以保护细胞不受强烈紫外线伤害，他们的数量越多，吸收的光线越多，眼睛呈现的颜色也就越深。其他眼睛颜色由其他色素决定的么？既然黑眼睛是由黑色素决定的，那蓝眼睛难道是由蓝色素决定的么？但人的眼睛是没有蓝色素的，那么蓝眼睛是怎么来的呢？其实，蓝眼睛是源于黑色素的怠惰，虹膜里的黑色素的多少受到多个不同基因的影响，比如HERC2基因以及OCA2基因就和色素的合成有关，当其中一些基因发生变化基质中的黑色素会减少，然后变得相对透明，当光被反射后，经过这层基质时，就会发生瑞利散射，让眼睛看起来显出蓝色。
这就好比天空没有蓝色素却呈现出蓝色的原理差不多，而绿眼睛则是这种结构色与色素色叠加的结果，它们的虹膜基质中有一些淡黄色的色素，上述这些条件的席位差异也造就了褐色等其他颜色的眼睛。在很久以前，人类眼睛只有一种颜色在一万年前，金发碧眼是不存在的。人类的祖先法发源于非洲大陆，那地方紫外线强烈，自然选择下的人类皮肤和头发普遍是深色的，同理，为了保护眼睛，虹膜也是深棕色甚至接近黑色，但随着人类的四处迁徙，深色眼睛不再是生存的必要条件。
