孙策听说周瑜前来投靠，自然非常高兴，但他给予周瑜的待遇，再也没有之前那么好了！《三国志》：策亲自迎瑜，授建威中郎将，即与兵二千人，骑五十匹。从表面上来看，孙策对周瑜还是不错的，又给官位又给兵，但事实上，周瑜已经被排除在了孙家的核心团队之外！按照常理来说，以周瑜和孙策的友情，再加上孙策创业之初，周瑜所提供的巨大帮助，他完全算得上是孙家创业团队的元老，他应该进入孙家核心班底的，可就是因为他当年离开了孙策，转投了袁术，所以原本属于他的胜利果实，已经没有了。
也正是因为这个原因，所以我们可以看到，周瑜投靠孙策以后，虽然在战场上屡立大功，但他一直被调任在外，并未能回到集团核心，相当于说，周瑜拼死拼活，不管立下多大的功劳，都被排除在了核心团队之外，自从他离开孙策的那一刻开始，他就永远不可能再重新迈入核心团队了。这一点，从孙策临死前所说的话也可以看出！孙策的临终嘱托对于孙策的临终嘱托，很多人一直认为是这样的：内事不决，可问张昭；外事不决，可问周瑜。
然而事实上，上述话语都是三国演义虚构的，正史中孙策的临终托孤，压根儿就没有周瑜什么事情！《三国志》裴松之注引《吴历》：策谓昭曰：“若仲谋不任事者，君便自取之。正复不克捷，缓步西归，亦无所虑。”可以看到，孙策临终托孤的人选，乃是张昭，对于他来说，张昭是最值得信任的！而周瑜战功虽高，但当年他抛弃了孙策选择了袁术，他并不值得信任！很多人认为，孙策之所以没有托孤给周瑜，乃是因为周瑜当时驻守在巴丘，并不在江东，然而若是孙策真心信任周瑜，他完全可以留下诏书，让周瑜参与辅政，亦或是像刘备一样，直接把李严和诸葛亮都叫过来，这很简单啊！说白了，周瑜还不如李严，孙策对周瑜并不放心！孙策死后，周瑜干的事情，又再次让孙权产生了巨大的敌意！孙策身死，周瑜作为臣子、朋友，前来奔丧，这是非常正常的事情，但是周瑜却带兵前来，这个举动就颇有威慑意义了！《三国志》：五年，策薨，权统事。
瑜将兵赴丧，遂留吴，以中护军与长史张昭共掌众事。注意“瑜将兵赴丧”这五个字，这其实是一个非常危险的举动，作为外臣，是不可以带兵入京的，这就好比当年的董卓带兵进洛阳，你想干什么？孙策刚死，周瑜就带兵前来，美其名曰奔丧，可奔丧需要带这么多军队吗？孙家虽然失去了孙策这个主心骨，但孙权还活着，孙家大部分人还活着，周瑜此举，与反叛无异，放在和平时期，孙权完全可以砍了他的头。
然而从三国志的记载来看，最终周瑜不仅没有被治罪，反而留下来和张昭共掌权力了，令人吃惊！孙策临终前，托孤的大臣明明只有张昭一人，但周瑜带兵来了后，掌权的人就变成了两个，变成了周瑜和张昭，这说明什么？不就说明周瑜抢夺了原本属于张昭的权力吗？也就是说，周瑜带兵奔丧，其实就是前来抢夺权力的，最终张昭为了大局退了一步，所以周瑜才没有和孙家大动干戈！赤壁之战赤壁之战，很多人都只看到孙权和周瑜君臣的精诚合作，却没看到此事背后的各种算计！当年曹操南下，孙权问遍了群臣的看法，可就是没有问周瑜的看法，令人非常奇怪，最终还是鲁肃提醒孙权，孙权才召回周瑜，询问周瑜对赤壁之战的看法，由此可见孙权对周瑜是非常不信任的，遇到大事他根本不想咨询周瑜的意见。
周瑜回来后，力主抗曹，希望孙权把所有军队交给他，由他带着去抵挡曹操。然而孙权却只给了周瑜三万人，并没有把所有军队交给周瑜。另外，为了制约周瑜，孙权还派了一个和周瑜完全不对付的程普一起指挥军队，且程普的军事决策权丝毫不低于周瑜，由此可见孙权对周瑜是充满了防备的，毕竟当年周瑜抛弃孙策投靠袁术，后来又带兵奔丧抢夺权力，给孙权留下了深刻的印象。
赤壁之战，周瑜大败曹操，然后开始攻略荆州。在这种情况下，孙权并没有增援周瑜更多的兵马，以便让周瑜扩大战果，反而是自己带人去攻打合肥，令人感到非常奇怪？为啥孙权不去支援周瑜呢？要是去支援了周瑜，刘备怎么可能抢下荆南四郡？再然后，周瑜在打下南郡以后，建议打击刘备集团，干掉刘备，自己再带人进攻益州，这样东吴就可以拿下长江南边的广袤土地了。
然而孙权却并没有接受周瑜的建议，他不仅没有软禁刘备，还和刘备联姻了，而且孙权在答应让周瑜去攻打益州后，周瑜转头就暴毙了。周瑜暴毙后，孙权又立马解散了周瑜攻打益州的团队，并把南郡借给了刘备，令众人颇为不解！前脚孙权还答应周瑜，让他以南郡为基地攻打益州，怎么后脚攻打益州的团队就被解散了，南郡还被给了刘备？这战略转化得也太快了吧？说白了，这背后的原因都是因为孙权不信任周瑜！在孙权看来，周瑜这个人并不忠心于孙家，且能力超强，已经有功高盖主之嫌了，而且野心志向颇大，若是让他拿下了益州，对孙权会是一个巨大的威胁，所以孙权不愿意按照周瑜的计划行事，不愿意软禁刘备，反而是要和刘备联合在一起。
