但最后，由于自来也本人的拒绝，没有上任火影职位。后来找到纲手之后，回到村里就上任了五代火影。四代火影：正常来说，论当火影的资格，水门还是比起大蛇丸要差一点。这里并不是实力上的问题。大蛇丸曾经是三代火影最骄傲的弟子，无论是才华还是人品。三代火影完全就把大蛇丸当成自己的儿子看待，亲手亲为的栽培他。假如大蛇丸听三代的话，好好继承火之意志的话。
四代火影那肯定就是雷都打不动的大蛇丸继承了，这是绝对的。水门为何不能当四代火影呢？主要还是太年轻，虽然有着功勋伟绩，但水门是自来也的徒弟，与大蛇丸比背景关系的话，肯定是没有大蛇丸强硬的。但偏偏大蛇丸走向了歧途，而这个时候偏偏水门又继承了火之意志。可以这么说，四代火影位置，完全就是大蛇丸自己作没了的。就因为这个事情，大蛇丸一直怀恨在心。
最后又因为自身实验研究问题，不得不逃离木叶，成为一个常年无法正常在阳光下行走的叛忍。所以，从背景故事来看。大蛇丸的实力肯定是没什么疑虑的。曾经也是拥有当四代火影资格的忍者。三代火影的尸鬼封尽限制了大蛇丸的实力与三代火影一战之后的大蛇丸，由于被三代用尸鬼封尽封印了双手的灵魂。完全无法使用忍术。基本上已经失去了双手行动的能力。
在寻找纲手的时候，大蛇丸使用忍术，还是药师兜在旁边辅助结印，然后在用到大蛇丸手上的通灵印记。就连通灵万蛇都是药师兜帮他结印。至此以后，大蛇丸的实力就一蹶不振。后来纲手不肯为大蛇丸医疗双手，实在没办法，通过不死转生后，大蛇丸获得了一双手。但始终不是原配，使用起来还是有点瑕疵。在和四尾鸣人的战斗中，就局限了大蛇丸很多能力。
但还是用出了三重罗生门。这基本上是大蛇丸继三代封印事件过后自己结印使用的第一个忍术。当然，大蛇丸本身就已经不是正常的人类，使用一些奇怪的招式也是理所当然的。比如口中吐蛇，三代封印的是大蛇丸的双手，又没封印嘴。大蛇丸很多技能都是从口中出来的，包括草雉剑。忍战——蛇叔的"春天"双喜临门第一喜：佐助为了寻求知晓一切的人，复活了大蛇丸。
大蛇丸破解了尸鬼封尽以后，自己原本的双手回到了身上，立马就使用了秽土转生。第二喜：大蛇丸得到了至今最强的肉体——柱间细胞克隆体"白绝"。一身的柱间细胞，即使战力接近巅峰的二代也是无法抗拒大蛇丸使用的秽土转生。足以看来，此时大蛇丸的实力究竟有多强。第四次忍界大战，大蛇丸恢复了比以前还要更强的力量。但……为时已晚。
忍界大战，俗称神仙大战，拼的就是血统的力量。即使大蛇丸此时已经拥有了柱间细胞，但连柱间本人此时都已经沦落到辅助位置了，大蛇丸还能强到哪里去？所以，蛇叔的成长总是比忍界的发展要慢一步。不过，忍战结束以后，大蛇丸成功洗白。隐居忍界的大蛇丸已经又在偷偷研制更强的仙术的之力。所以，博人传中的大蛇丸到底有多强，还是个未知数。
但我相信一定是可能匹敌大筒木的劲敌。大蛇丸在火影忍者中的跌宕起伏比较大。巅峰时期就因该是入侵木叶村的时候，基本上就是按照最强的反派去设定的。先是杀了四代风影，又到毁了木叶村很多建筑，然后还杀了三代火影。最后还诱导走了宇智波一族的遗孤宇智波佐助。但后来被佐助吸收，好不容易趁佐助虚弱了出来透个风儿，又被宇智波鼬的十拳剑封印了。
《火影忍者》中，大蛇丸和“晓”之间究竟有什么矛盾？你怎么看？
晓组织是火影忍者中一个五大国之外最强大的忍者组织。它的核心成员大多都是各国的S级叛忍组成的。而这些叛忍其实没有几个是和晓组织是一条心的。每个人加入晓组织都有各自的原因。剑客觉得当晓组织不能满足他们的需求的时候，大部分人都会像大蛇丸一样叛逃晓组织的。毕竟这些人都是有叛逃前科而且实力十分强大的。晓组织之所以可以吸纳如此多的叛忍，剑客就觉得主要是这几个原因。
一、晓组织首领佩恩十分强大，拥有传说中六道仙人的眼睛轮回眼。从究极风暴中的剧情我们可以得知，晓组织的成员很多都是由组织的人邀请来的，而能被晓组织看上的叛忍实力都十分厉害，脾气自然也不是很好。可以说晓组织的成员大半都是挨了一顿揍才加入的晓组织。本身作为叛忍就已经被五大国通缉，再招惹打不过的晓组织，还不如加入进去。
二、利用晓组织的资源完成自己的梦想。晓组织很多人都是因为自己的追求才叛逃的村子，但是孤身一人想要完成自己的追求太难了。比如角都一个人做赏金任务赚钱肯定比不上有晓组织情报赚钱来得快。蝎进行各种傀儡实验的材料也可以利用晓组织来收集。三、晓组织的管理十分宽松。晓组织对于这些核心成员的要求可以说是十分之低。不需要打卡签到，也没有一些强制要求，只要做一些任务和抓捕尾兽就可以随便去做自己想做的事情。
有了这几点可以说晓组织是叛忍的绝佳去处。那么为什么大蛇丸还要叛逃晓呢？因为晓的这些福利对于大蛇丸来说都是没有多大用处的。大蛇丸的追求是永生和学会所有的忍术。他加入晓组织可以说就是为了研究佩恩的轮回眼和鼬的万花筒写轮眼。但是大蛇丸刚一出手，就被鼬直接秒掉。一方面大蛇丸的诉求没法完成，不断的做任务和收集尾兽是非常影响大蛇丸搞科学研究的。
而且有很多科研基地的大蛇丸可是有钱人，而晓组织前期最缺的就是钱；另一方面成名多年的三忍之一却被自己村子的后辈打败，这是很丢脸的事情。而且论势力的话，大蛇丸是不逊色于晓组织的。晓组织也不过是雨忍村一个总部。但是大蛇丸不但有音忍村作为据点，在各大国都有秘密基地。麾下的人才更是都极为崇拜大蛇丸。别的人可能需要晓组织的势力来完成一些事情，大蛇丸却完全不需要。
他自己经营多年的秘密基地和搜罗的人才已经可以堪比五大国的忍村了。像香菱、君麻吕、重吾、水月、红莲、音忍五人众这些手下，都是不逊色于五大国忍村年轻一辈的。如果这些人能够成长起来，大蛇丸成为音影都是有可能的。最关键的是，大蛇丸虽然硬实力不强，但是他的逃命能力绝对是满级的。大蛇丸流替身术、不尸转生、秽土转生等等这些能力绝对可以让大蛇丸活到忍者时代终结。
不管是叛逃木叶还是叛逃晓组织，大蛇丸都有自信自己能活的好好的。而事实上也确实如此。木叶一直没能抓到大蛇丸，晓组织的蝎也一直到死也没有完成抓捕大蛇丸的任务。所以大蛇丸对于晓组织根本是无所谓的。何况大蛇丸本身的性格也是不相信任何人，以自我为中心的。他为了自己的目的可以抛弃木叶的同伴，又何尝不能抛弃晓组织呢？在确定了轮回眼和万花筒写轮眼不能到手的情况下，大蛇丸就把目标对准了佐助。
但是晓组织初期是以收集金钱为主的，肯定不愿意暴露在最强忍村木叶的眼下。因此在晓组织会影响大蛇丸计划的情况下，大蛇丸自然会毫不犹豫的退出晓组织。而晓组织既不是慈善组织也不是公益组织，怎么可能让大蛇丸想来就来，想走就走。先不说大蛇丸走之前袭击了这种的成员鼬，还在蝎身边派了间谍兜，单单是大蛇丸辞职的时候没有把组织的戒指上交就足够晓组织对付大蛇丸了。
《火影忍者》中，大蛇丸的“五行封印”与自来也“五行解印”对鸣人有何影响？
《火影忍者》鸣人身上最开始的封印就是双重四象封印构成的八卦封印，这个封印除了能封印九尾查克拉到鸣人体内，还有一点作用，就是四象封印之间泄露出来的查克拉能为鸣人所用。在中忍第二场考试时，鸣人小组遇上大蛇丸，大蛇丸在鸣人肚子上打上五行封印术，这个术破解难度很高，需要用同系统、类别、学习难度、效果范围的五行解印才能解封。
第二场考试结束后，鸣人独自修行时，五行封印的效果就显现出来，就是没有办法让鸣人很好的凝聚查克拉，更没有办法顺利使用。按自来也的解释就是，双重四象封印的偶数封印，能保障泄露出来的九尾查克拉转化成鸣人的查克拉，加上五行封印的奇数就限制了这个作用，鸣人和九尾的查克拉混合在一起，造成不稳定，这也是为什么鸣人努力练习水上行走过程不顺畅，五行封印就是罪魁祸首。
通俗点来说就是，五行封印的作用就是封印魔物，双重四象封印下泄露出来的九尾查克拉也是其中之一，封印了就让双重四象封印的一部分作用限制。而自来也的五行解印就简单多了，就是把五行封印的限制取消掉，让双重四象封印的效果继续运转，鸣人在接触五行封印后，立马就能在水上站立行走，原本他就掌握了这个技巧，但是由于五行封印的存在，查克拉没有稳定的凝聚和使用。
