一般治疗猫咪的口腔炎的方法就是投用抗生素和干扰素。抗生素适合口腔炎症状较轻的猫咪，且短期投用效果最佳（长期使用的话会出现耐药菌）；干扰素适合长期使用，比较容易控制口腔炎的症状。（有时候也会用到类固醇，但有副作用）抗生素先来说说抗生素，抗生素的作用就是抑制口腔内异常增加的细菌。其中主要给猫咪用的的抗生素是“阿奇霉素”，这种抗生素原为人用抗生素，是一种广为人知的治疗感染性衣原体、支气管炎、肺炎、口腔炎等疾病的药物。
阿奇霉素除了能抑制口腔内细菌的增殖以外，还具有抑制口腔内炎症的效果。阿奇霉素适合猫咪短期服用并且效果会显著提高（每天1次或者每3天服用1次），这对于那些不喜欢吃药的猫咪而言至少可以减轻药物给它们带来的负担。阿奇霉素算是治疗猫咪口腔炎比较不错的一种抗生素，有些猫咪在服用了阿奇霉素后很快就使得口腔炎的症状减轻了。
不过虽然阿奇霉素对猫咪的口腔炎有很好的治疗效果，但是它会影响猫咪的消化道吸收能力。另外，抗生素的主要作用就是抑制细菌的增殖，那么当猫咪服用了抗生素后也会使肠内细菌减少，导致体内失去平衡，继而出现腹泻、呕吐等副作用。而由于阿奇霉素还会使得消化道运动机能进入亢奋的状态，继而就会导致猫咪更加容易引起腹泻。（有数据显示，服用阿奇霉素的猫咪中大约有40%会引起腹泻。
）因此铲屎官若给猫咪服用阿奇霉素的话，最好是在猫咪空腹时服用，而且在猫咪服用2小时以内不要吃东西。阿奇霉素本来是人用抗生素，于是在给猫咪服用时一般按照猫咪体重每1Kg服用5~15mg 的量，每隔12~24小时就要服用一次，服用天数、服用量一定要遵照兽医的指示来做。毕竟它是人用抗生素，无论铲屎官给猫咪是多吃了还是少吃了都会产生副作用，反而使得猫咪的身体雪上加霜。
而且长期服用抗生素会使细菌对抗生素渐渐产生抵抗力，这时候若再继续使用抗生素的话，就会发现原本效果很好的抗生素竟然效果变差甚至无效，这就叫做耐药性。干扰素干扰素（IFN）对阻止病毒的增殖、激活免疫力和炎症控制上起到了很好的作用。而且干扰素本来就存在于体内，因此长期给猫咪使用也很少会出现问题，对控制猫咪的口腔炎起到了很好的效果。
如今仍存在干扰素制剂，一般是通过皮下注射来把药物投入到体内，可这会给猫咪带来很大的压力，毕竟猫咪一般都不会喜欢去医院。对于干燥粉末类干扰素制剂而言，在给猫咪使用时得先对其进行溶解，然后给猫咪口腔内每天滴1次，持续2~5周就会令猫咪的口腔炎大大改善。当然这个方法并不是以根治猫咪的口腔炎为目的，而是减缓口腔炎给猫咪带来的负担，加之能长期使用且有效果的原因，就能让猫咪不会因为口腔炎而一直处于痛苦中。
