2004年，九江市第二人民医院并入九江学院。2012年11月，学校入选第一批卓越医生教育培养计划项目试点高校名单。2014年11月，解放军第171医院正式挂牌为九江学院附属171医院。学校占地2850多亩，现有主校区、浔东校区、庐峰校区、南湖校区、八里湖校区五个校区，校舍面积130余万平方米， 全日制在校生3.8万余人。
学校还设有1所直辖“三级甲等”附属医院。学校现有专任教师1900余人，其中有副高以上职称的830余人，博士230余人；研究生导师70余人；入选江西省“赣鄱英才555工程”3人；获得国务院特殊津贴和省政府特殊津贴10人；江西省高校学科带头人和青年骨干教师44人；江西省高校名师6人；入选江西省“百千万人才工程”14人。
近年来，学校还特别聘请了100多位知名专家学者为学校兼职和客座教授。中国科学院院士杨叔子教授受聘为学校名誉校长，中国科学院院士潘际銮教授受聘为学校学术委员会主任；中国工程院袁隆平院士、程天民院士和中国科学院严陆光院士等专家学者受聘为学校名誉教授。学校现有21个二级学院。设有经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学、艺术学十一大学科门类，涵盖82个本科专业。
有35个国家级、省级“质量工程”项目，包括特色专业、精品课程、人才培养模式创新实验区、教学创新团队、实验教学示范中心、双语教学示范课程等；有186个国家级、省级“本科教学工程”项目；有10个省级重点学科、8个高职高专省级示范专业和系列优质课程；并设立了“流域管理与生态保护”博士后科研工作站和杨叔子院士工作站，柔性引进了美国耶鲁大学、华中科技大学、中国人民大学和上海交通大学等多个高端学术团队。
学校依托“学科联盟”，与南昌大学、江西财经大学签署合作协议，遴选了8个专业开展硕士研究生联合培养工作，已获省教育厅批复与教育部立项，从2016年起开展“联合招生、独立培养”。2015年，学校完成的“新型光电功能材料的制备、能量输运与转换机理研究”成果获江西省政府自然科学二等奖，实现了省政府科技二等奖零的突破。
学校建有庐山文化研究中心、鄱阳湖生态经济研究中心、沿江产业开发研究中心、社会系统学研究中心、昌九一体双核发展研究中心、公共外交研究中心、国际农村医学教育研究中心、数控技术研究所等32个科研机构。学校大力推进“山江湖”学科建设工程，紧密围绕以庐山为地标的中华优秀传统文化、九江沿江产业开发与长江中游经济带建设、鄱阳湖生态经济区及生态文明示范区建设，形成了明显的优势和特色，产出了一批优秀研究成果。
