2004年5月国家教育部批准在三校合并的基础上筹建蚌埠学院。学院严格按照国家教育部关于“加大投资力度，加快校园规划和建设，加强学科专业建设和师资队伍建设，努力实现三所院校的实质性融合，不断改善办学条件，着力增强学校的科研能力、提高学术水平，争取尽快达到国家规定的有关本科学校的设置标准”的要求，认真落实国家教育部专家组、省教育厅专家组的指导意见，全面贯彻“以筹促建、重在建设”的指导思想，充分调动师生员工的主动性和创造性，大力推进新校区建设、教师队伍建设、学科专业建设和基础设施建设，努力提高教育教学质量和科研水平，各项工作都取得积极进展。
2006年12月国家教育部全国高等学校设置评议委员会专家组对学院筹建工作进行了实地考察、全面评估。2007年1月29日，全国高等学校设置评议委员会五届一次会议全票通过了蚌埠学院正式建校。 学院全景正在加载学院全景蚌埠学院占地80公顷，其中新校区65公顷，坐落于蚌埠大学园区内，东靠建设中的京沪高铁蚌埠站，南倚芦山，西临龙子湖，北接安徽财经大学和蚌埠医学院，依山傍水，风景秀丽。
按照本科院校标准，网络化、信息化、智能化、生态性要求和1万名全日制在校生规模一次规划、分期建设。蚌埠学院新校区已建校舍20万平方米，在建校舍近3万平方米，现有实验室17个大类、97个分室，教学仪器设备总值达到4000多万元；多媒体教室和语音实验室座位达到3000座；馆藏纸质图书56万册，电子图书25万册，共计完成投资4亿元。
学院现有专任教师477名，2007年度省级教学名师（本科部分）1人，副高以上教师150名，博士、硕士学位教师199名，另有在读硕士、博士121人，非教师系列高级职称近30人。学院设有淮河文化研究中心、复杂系统研究所、生物技术研究所、写作研究所、金工实习工厂、食品加工实习工厂等机构。学院一角正在加载学院一角教学与科研是高校发展与培养人才的两大基本功能，学院积极发挥学科交叉的综合优势，加强实验教学和实践教 学，注重教学与科研的结合。
近几年,学院共承担省级科研项目53项，与有关企业签定在研项目19项，发表论文约600篇，发明专利3项，省级本科精品课程1门，合作共建省级本科精品课程6门，省级专科精品课程3门，获各类奖项90项。历史沿革建校前身蚌埠高等专科学校蚌埠高等专科学校前身为为蚌埠食品工业专科学校和蚌埠联合大学。原蚌埠食品工业专科学校于1984年6月创办，附设在蚌埠联合大学内，招收1个班；1985年，迁至蚌埠教育学院院内，招生、教学由教育学院统一管理。
原蚌埠联合大学创建于1984年6月，属市辖高校，初办时以东风四街小学为校址，于1985年11月在曹山脚下建新校，占地45亩。1990年6月6日两校合并为蚌埠高等专科学校。蚌埠教育学院该校创办于1978年，始称安徽大学蚌埠师范专科班，招收中文、数学、物理3个班，学生109人，时隔不久改称安徽师范大学蚌埠师范专科班。
嗣后，1979年9月改名为安徽师范大学蚌埠师范专科学校，1980年8月改称蚌埠教师进修学院，1982年改称蚌埠教育学院。1983年秋，招收三年制在职业余进修学员100名，另招收业余走读形式的中文、数学两个专业函授学员2378名，并分别在蚌埠、淮北、宿县、滁县设19个教学点。1984年秋，曾为新疆、甘肃两省代培训学员82名。
蚌埠职工大学蚌埠职工大学是1997年9月8日经省、市人民政府批准，由原蚌埠职工大学、安徽广播电视大学蚌埠分校、蚌埠机械职工大学合并成立的一所新型的综合类的成人高校，与安徽电大蚌埠分校实行“一个机构、两块牌子”的办学机制。原蚌埠职工大学于1984年经省人民政府批准，教育部备案成立；原蚌埠机械职工大学前身是市重工业局“七·二一”大学，于1982年筹建为市重工业局职工大学，1985年4月经安徽省政府批准，改为市机械职工大学；原安徽广播电视大学蚌埠分校成立于1979年2月。
合并建校2002年4月，省教育厅、蚌埠市委、市政府经过研究，决定将蚌埠高等专科学校、蚌埠教育学院、蚌埠职工大学三校合并。2004年5月18日，教育部正式批准同意在蚌埠高等专科学校、蚌埠教育学院、蚌埠职工大学的基础上筹建蚌埠学院，筹建期为两年。2007年3月19日，教育部正式发文同意在蚌埠高等专科学校、蚌埠教育学院、蚌埠职工大学合并基础上正式设立蚌埠学院，同时撤销蚌埠高等专科学校、蚌埠教育学院、蚌埠职工大学的建制。
