那就是倚天剑和屠龙刀中藏有“九阴真经”秘笈和“武穆遗书”，请峨眉掌门等到时机成熟，取出秘笈和兵书，交给一位众望所归的英雄，号令天下豪杰，驱逐蒙元，恢复汉人天下。黄衫女说，风陵师太传位给灭绝师太时，自然将这一番遗命反复嘱咐，但灭绝师太一生所为，却总是与这遗命背道而驰。比如，灭绝一生视明教为生死大敌，但明教不过是行事诡秘，兼之因为教众多了，难免有些恶徒罢了。
灭绝师太与明教杨逍、谢逊等人人有些私人恩怨，却与整个明教为敌，对明教在各地起事，反抗蒙元暴政的义举视而不见。后来，她更是中了成昆的挑拨离间之计，带领峨眉和少林、武当等五大派一起杀上光明顶。若非张无忌横空出世，力挫六大派，明教已经灰飞烟灭，又何来当下如火如荼的义军呢？听黄衫女这样说，周芷若本能地想反驳她，细想黄衫女说的句句在理，根本不知道该如何辩驳。
只听黄衫女继续说道，武学之道，不仅在于个人的资质和武功秘笈，心胸和格局也同样重要，你师父灭绝师太，坐拥峨眉“四象掌”、“九阳功”等绝学，成就不过尔尔，原因就在于此。不过，心胸和格局也是可以培养的，姐姐如今请你加入古墓派，便是有心培养你一番，免得耽误了你这块良才美玉。周芷若见黄衫女言辞恳切，便有了几分心动，只是忽然想起她说起峨眉秘辛，如数家珍。
在江湖中两次露面，也都是在极为关键的时刻。心中不免有几分好奇，便将心中的疑问说了。黄衫女闻言微微一笑，说我若把这个大秘密说给妹妹听了，妹妹就必须加入我古墓了，否则姐姐我只好杀人灭口了。周芷若知她在开玩笑，便继续催促她说下去。结果黄衫女说出一番话来，把周芷若惊得目瞪口呆。黄衫女告诉周芷若，自己叫杨瑶琴，是古墓派的传人，当年的神雕大侠杨过和小龙女是她的祖父母。
当年襄阳失陷，杨过听到消息晚了，没能及时赶过去营救郭靖、黄蓉等人，深以为憾。于是，他决心创建一个覆盖全国的情报网，能够及时传递消息。这个消息网经历三十年时间，到了黄衫女的父亲手中才真正完成，后来由黄衫女继承下来，这就是黄衫女能够为丐帮拨乱反正，后来又及时救下谢逊的原因。黄衫女最后说，如今天下义军形势喜人，将蒙古人赶回大漠是早晚的事，但恢复了汉人天下之后，仍旧有很多事可以做，希望周芷若可以助她一臂之力。
作为回报，古墓派的各种神功绝学，周芷若无论想学什么，她都有求必应。周芷若想到自己孤身一人，也没有事情可做，便答应了黄衫女的请求。传说此后，周芷若一边在古墓勤修武功，一边帮着黄衫女处理情报网事宜，并根据情况决定是否要出手。古墓派武功博大精深，但黄衫女首先给周芷若修炼的，却是王重阳留下的部分“九阴真经”。
周芷若本有些“九阳功”根底，但修炼了倚天剑中的速成版“九阴真经”后，“九阳功”已被全部化去，只剩下速成的九阴真气。如今周芷若再练原本的“九阴真经”，自然比从头练快上许多，七年时间已然大成。此后三年，周芷若还练了古墓派的“捕雀功”、“天罗地网势”和“美女拳法”等武功，由于她有“九阴真经”为基，练起这些武功来，几乎都是一学就会，一会就精。
十年中，周芷若不但武功大进，成为超一流高手，还因日日跟着黄衫女，学她为人处世，心胸渐渐宽广起来，不再纠结于一时的得失荣辱，并在不断的救危济困、惩恶扬善中找到了乐趣。1361年夏，关中大旱，饿殍遍野，朝廷派官员带着粮食前去赈灾，周芷若也早早得到消息，组织江南一批富户捐粮捐物。赈灾粮到了渭南后，知府见朝廷的粮食加上民间捐赠的粮食，已超过当地灾民所需，便和朝廷的两位官员商量，贪墨掉一部分粮食，三人平分。
结果他们三个当夜便都被人打晕过去，无声无息的拔掉了两颗门牙。等他们疼得醒过来，看到枕边有一封手书，上面写着十六个字:妄动贪念，略施小戒。真敢伸手，满口无齿（无耻）。不消说，这正是周芷若的手笔。却说三人大惊，从此再不敢动一分赈灾钱粮。后来，三人还因为赈灾有力，被灾民赠送“万民书”，并受到了朝廷的嘉奖，升官进爵，倒是因祸得福了。
1381年，工部尚书薛祥被人连累，受杖刑而死。薛祥生前做了不少为国为民的好事，因此他一死，天下很多人都非常伤心。但也有一些人拍手称快，并想赶尽杀绝，趁着薛祥的四个儿子被流放琼州的机会，收买亡命之徒进行刺杀，想让薛祥一家绝后。周芷若从情报网得知这个消息后，一路暗中护送薛祥的四个儿子，并击杀“雁荡七寇”、“横断五虎”等二十七名贼人，保护薛祥四子平安抵挡琼州。
