航空理论课程主要包括空气动力学、飞行力学、空中领航学、空中射击学、航空气象学、飞机构造。航空发动机、计算机应用、专业英语等。学习时间为四个月，航空理论教育的目的是使学员掌握飞行有关知识，为顺利地跨人空中实际飞行打下理论基础。 初教机训练，时间为1年。主要进行初教六飞机的基本驾驶技术训练，初教六飞机属于低速、轻型、螺旋桨飞机。
初教机训练主要是为高教机飞行训练打基础的，在飞行学习过程中，由具有理论功底扎实、飞行技术烟熟、教学经验丰富的飞行教官任教，一般一名飞行教官带两名学员，整个飞行学习过程中，教与学的人员比例为2:1，也就是说，两名飞行教学人员培养一名飞行学员。经过1年的训练，学员能熟练地掌握起落航线飞行驾驶技术，熟练地掌握暗舱仪表飞行驾驶技术，熟练地掌握简单特技和复杂特技飞行驾驶技术，熟练地掌握双机编队简单特技飞行驾驶技术，掌握航行的基本方法，掌握夜间简单气象飞行基本驾驶技术。
学员在学习飞行技术的同时，还要进行军政文体四个方面的全面培养。结业时，通过飞行技术、航空理论、政治理论。地面军事、军事体育的全面考核，成绩达到初教机结业水平准予结业，转入高教机飞行训练。 第三阶段：高教机训练阶段 经过一年的初教机训练，学员基本上掌握了飞行活动的规律，插上了翅膀，转人高教机训练。高教机一般为亚音速喷气式教练机，高教机训练时间为1年，经过1年的训练，学员应达到的技术水平是：熟练地掌握起飞行驾驶技术，熟练地掌握特技飞行驾驶技术。
毕业时撰写毕业论文，通过毕业考核和论文答辩，成绩合格，准予毕业。学员毕业将获得大学本科学历，被授予中尉军衔，任命为副连职，绝大部分将被授予军事学学士学位（优等生授予上尉军衔，任命为正连职），此时完成由飞行学员向飞行员的转变。毕业后，歼击机飞行学院的飞行学员分配到航空兵训练基地进行战斗机改装训练。轰运、轰领飞行学院毕业的学员则分配到轰炸机飞行部队或运输机飞行部队进行改装训练或直接担负空中任务。
