虽然他身为明教法王，他不愿连累明教，毕竟一切以明教大局为重，绝不可能让明教因为自己深陷重围。徽宗皇帝为了一举铲除明教，兵分两路，命童贯为宣抚使率军十五万前往东南镇压起义军，又派黄裳领兵远赴西域昆仑山进攻光明顶明教总坛，企图将明教连根拔起，让其教亡宗灭。
朱元璋为什么要叛离明教？
明教与朱元璋的关系可以从两方面来说，金庸小说里，明教是由波斯明教传入中国，又叫拜火教，摩尼教，因教义与中国相异被斥为异端教派，也被中原武林称魔教，因为是一个教派具有很强的煽动性，因为被压迫而奋起造反的人们都聚集到了明教旗下，有野心者则利用无知民众以达到自己的权力欲望，小说中朱元璋成功了，但是立国之后明教就成了国家不稳定的因素，一个国家不可能让一个宗教来左右，所以朱元璋只能铲除明教了。
明教怎么来的，第一任教主又是谁？
明教起源于摩尼教，创始人是摩尼，但他不是第一任教主。就如道教不是老君建立的，佛教不是如来建立的，儒教不是孔子建立的，基督教不是耶稣建立的一样，摩尼教也不是摩尼建立的，摩尼只是创立了这套学说而已。真正建立摩尼教的是山中老人霍山，他把摩尼教徒组织成一个严密强大的教派，并且传播到世界各地，虽然早在东汉摩尼教义就传入了我国，但是一直影响了了，直到唐朝武则天时期方才发展壮大，武则天想借摩尼教的弥勒佛下凡的传说给自己篡唐铺路。
《倚天屠龙记》中，明教为何是魔教？
【坚持原创，杜绝抄袭】 欢迎关注羽菱君扯金庸武侠前后传系列第七十九期：“倚天屠龙记篇”《魔教称号之谜》。明教被之为魔教，实际上历来已久，到六大门派结盟，只不过是为了各自利益，将明教统称“魔教”，然后打着“斩妖除魔”的旗号用以来掩饰自己的作恶而已。因此解答这个问题，可以分成两个方面来解析，第一个方面是明教被称为“魔教”的由来；第二个方面是明教为何会与六大派结仇。
一.明教被称为“魔教”的由来明教也称“摩尼教”，自唐中叶由波斯传入之后，经过几百年的发展，融入中土众教，薪火相传，各行各业各门各道皆有明教中人，他们遵从教义，特别是对社会最下层的贫苦民众尤为关照，以解救贫苦重见光明为己任，因而多得罪权贵，再加上历来行事偏激，多被误解。明教被称为“魔教”，刚开始是从被称为“邪教”而来，而明教被冠称为“邪教”的定义，最开始是从朝廷而来。
唐武宗会昌五年（845年）灭佛时，不单是佛教，明教也遭严重打击，转而成为秘密宗教。明教不拜太上道君，不拜至圣先师，也不拜如来佛祖，拜的是明教创教者摩尼。这与中华所奉的“儒释道”三教大相径庭，当权者为了稳固教化，统一思想，不免就会将明教称为“邪教”。又因创教者摩尼的“摩”字与“魔”字相通，因此朝廷鼓吹明教拜的外国老魔，也将明教称之为“邪魔外道”之教。
经朝廷鼓吹，上自庙堂，下到黔首，皆将明教以“魔教”冠称。而北宋末年，徽宗皇帝对明教“邪魔外道”的再次定义，就让明教的“邪教”之名，更加深化。1120年，教主方腊以明教“二宗”“三际”之说，组织教众，在睦州帮源发动起义。周边各地纷起响应，人数扩大到几十万，连续攻下杭州、歙州等六州五十二县，东南震动。徽宗皇帝接到此讯，龙庭大怒。
徽宗皇帝自称为“教主道君皇帝”，为道教教主，岂容异教在自己的地盘上拉抢教徒，蛊惑人心，更何况还结众造反，其心可诛。因此再次明确明教为“邪魔歪道”的定义。徽宗皇帝为了一举铲除明教，兵分两路，命童贯为宣抚使率军十五万前往东南镇压起义军，又派黄裳领兵远赴西域昆仑山进攻光明顶明教总坛，企图将明教连根拔起，让其教亡宗灭。
结果明教确实惨遭重创进入中衰时期长达一个半世纪，“魔教”之名更为坐实。有一年他治下忽然出现了一个稀奇古怪的教门，叫做什么‘摩尼教’，又叫‘明教’，据说是西域的波斯胡人传来的。他们一不拜太上老君，二不拜至圣先师，三不拜如来佛祖，却拜外国的老魔，可是又不吃肉，只是吃菜。徽宗皇帝只信道教，他知道之后，便下了一道圣旨，要黄裳派兵去剿灭这些邪魔外道。
新修版《射雕英雄传•第十六回》二.六派与明教的结仇明教与六大派的结仇，最开始源自于昆仑派。最终经为了铲除明教报复夺妻之恨的成昆串联，昆仑、峨嵋、少林、武当另加崆峒和华山六派组成的“抗魔联盟”成立，演出了一场围攻光明顶大戏。昆仑派：昆仑派与明教同处昆仑山脉，阳顶天接任教主之后，随着他的内修外攘，明教蒸蒸日上，开始全面复兴。
